U vremenu od 27. 8. 2020. godine do 6. 10. 2020. godine održano je 7 izvanrednih sjednica Stožera od čega je jedna održana elektronskim putem, a ostale su održane u prostorijama Vlade Županije Zapadnohercegovačke.

Županijski stožer civilne zaštite donio je prijedlog Odluke o proglašenju stanja nesreće prouzrokovane širenjem zarazne bolesti koronavirusa, a nakon što je Vlada donijela Odluku o proglašenju stanja nesreće, Stožer je od 27. 8. 2020. godine u stalnom zasjedanju. Na sjednice Stožera su se uglavnom odazivali svi članovi Stožera, a nerijetko u proširenom sastavu i načelnici gradskih/općinskih Stožera koji su bili pozivani na sjednice Stožera, kao i v. d. ravnateljica Zavoda za javno zdravstvo i ravnatelj Uprave za inspekcijske poslove.

Donesena je Odluka o nabavi zaštitnih i dezinfekcijskih sredstava kojom se zadužuje Uprava civilne zaštite da provede javnu nabavu za potrebe Ministarstva obrazovanja, znanosti, kulture i športa specificirano po njihovom zahtjevu, a za potrebe škola.

Na sjednicama Stožera usvajane su Zapovijedi koje su objavljivane na web stranicama Uprave civilne zaštite, te priopćene javnosti putem konferencija za novinare. Izdane su 4 Zapovijedi uključujući njihove izmjene i dopune, koje su većim dijelom usmjerene na organiziranje svečanih okupljanja i njihovom provođenju. Donesene su Upute za provođenje Zapovijedi, kao i Zaključak o davanju mišljenja na Plan korištenja sredstava posebne naknade, te Zaključak kojim se zadužuje Načelnik Županijskog stožera civilne zaštite da prikupi svu dokumentaciju o kršenju relevantnih pozitivnih propisa i Zapovijedi Županijskog stožera civilne zaštite.
Stožer svakodnevno izvještava javnost o stanju epidemije koronavirusa.